Nintendo 3DS'in gücünden yararlanan oyuncular, her muzu mümkün olan en hızlı sürede toplamayı hedeflerken, dönüp dolaşarak her yeni ve canlı dünyada kendilerini kaybedebilirler. Bu son bölüm, tek oyunculu bulmaca seviyeleri, Maymun Yarışı ve Maymun Dövüşü dahil olmak üzere üç yepyeni ilgi çekici oyun seçeneği içeriyor. Bu yeni oyun modları, oyunculara, avuçlarının içinde mümkün olan en iyi 3D sosyal deneyimi yaşayarak kablosuz bağlantı üzerinden dört oyuncuya kadar rekabet etme şansı veriyor. Buna ek olarak, Super Monkey Ball hayranları, bulmaca labirentlerinde tam bir hassasiyetle gezinmek için Nintendo 3DS hareket sensörü veya Slide Pad arasında seçim yapabilecek.