
Mega Man Star Force, Mega Man Battle Network serisinin finalinin üzerinden iki yüz yıl geçtiği, internet teknolojisine verilen önemin azaldığı ve bunun yerine EM Waves kullanılarak dünyanın ağ haline geldiği kurgusal 220X yılında geçiyor. Siber dünyalar ve NetNavis'ler Star Force'ta hâlâ mevcut olmasına rağmen, insanların bunlara olan bağımlılığı büyük ölçüde azaldı ve insanların artık Navi arkadaşları yok. bunun yerine Transers'a güvenmek. Dünyanın yörüngesinde dönen üç büyük uydu (Pegasus, Leo ve Dragon), Dünya atmosferi çevresinde var olan EM Dalga Dünyasına güç vererek dünyanın ağ halinde kalmasını sağlar. EM Dalga Dünyası normalde insan gözüyle görünmez olsa da, Görüntüleyici adı verilen özel bir gözlük (serinin ana kahramanının sahip olduğu) bir insanın bu diğer dünyayı görmesine olanak tanır. Ancak, Battle Network'ün siber dünyalarında olduğu gibi, EM Dalga Virüsleri de EM Dalga Dünyasında yaşayarak günlük yaşamda sorunlara neden olur.