Sniper Ghost Warrior 2 Siberian Strike, izole bir Sibirya bölgesinde geçiyor ve görevleri çözmek için daha açık bir dünya deneyimi sunacak. Oyunculara rehberlik edilmeyecek ve yeni konumda yollarını bulmanın tek yolu haritayı kullanmak olacak.
Sibirya'nın uzak, terk edilmiş şehri Birsovik'te Rus hükümeti, silah AR-GE'sine odaklanan çok gizli bir askeri tesis kurdu. Amerikan istihbaratı, tesisin yakın zamanda odak noktasını kitle imha silahlarına kaydırdığını öğrendi. Bir CIA ajanı olan M. Diaz, gerçeği ortaya çıkarmak için laboratuvar personeli kılığında gizli göreve gönderilir. Rapor göndermeyi bıraktığında hızla bir arama görevi oluşturulur.
Oyuncu, artık Asya-Pasifik bölgesindeki kitle imha silahlarına aç savaş ağalarının kaprislerine karşı koymak için bir araya getirilmiş bir grup olan Task 121'in saflarında yer alan, deneyimli bir özel operasyon keskin nişancısı olan Cole "Sandman" Anderson'ın yerine geçiyor. Anderson'a, Diaz'ın GPS sinyalini bulması, durumu yerinde değerlendirmesi ve ardından bulduğu istihbaratı çıkarması emredilir.